近年来，随着大棚蔬菜化肥使用量的逐年增加并累积，土壤酸化现象更加严重。而大多数蔬菜适宜于微酸性至中性土壤，过酸和过碱土壤不适宜蔬菜生长。其防治措施如下：
1.根治酸沉降污染源主要是控制氮、硫排放。其中燃煤脱硫处理和制成型煤对控制硫排放有良好作用，实行氮肥深施和提高氮肥利用，减少对大气排放。
2.品种合理布局。农作物品种应更多考虑其耐酸特性。如不同品种的蔬菜对酸的敏感程度不同，在pH值3.5的高酸性环境里，对酸敏感蔬菜如番茄、芹菜、豇豆和黄瓜产量可下降20%;而中等敏感性的生菜、菜豆和辣椒产量下降10%～20%;抗酸性较强的青椒、甘蓝、小白菜、菠菜和胡萝卜产量也会下降10%以下。因此，在酸性土壤上可种植耐酸的蔬菜品种。水旱轮作和间套作也是提高土壤对酸沉降缓冲能力和加快酸化土壤生态恢复的良好措施。
3.施用石灰。施用石灰是中和土壤酸性、控制土壤酸化和提高土壤pH值的重要措施。不同形态的石灰，中和酸性的能力有差异，如0.1kg氧化钙中和酸的能力约相当于0.179kg的碳酸钙。石灰施用量因土壤的潜在酸度而定。石灰及其他含钙的碱性物质，如钙镁磷肥、炼钢炉渣、窑灰钾、草木灰等，不仅可以中和土壤酸度，还可以为蔬菜补充大量的钙。当土壤受到硫黄矿或硫铁矿所污染形成强酸性土壤时，可先采用漫灌洗酸后，再以石灰中和酸度。若是水田，且长期淹水，一旦脱水干燥，立即表现极强酸性，pH值可达2～3之间，寸草不生，此时以水洗及用石灰中和，可获显著效果。
4.合理施肥。大量有机肥料的施入，不仅可增加大棚土壤有机质的含量，提高土壤对酸化的缓冲能力，使土壤酸碱值升高。而且，有机肥料可以增加土壤有效养分，改善土壤结构，并能提高土壤有益微生物的活性，抑制蔬菜病害的发生。
增施尿素在短期内能引起土壤pH值急剧上升，升高的程度与施尿素的水平有关，尿素浓度越高，引起土壤pH值变化越明显。
改变施肥方式对提高pH值也很有帮助。蔬菜对氮、磷、钾的吸收比例一般为1：0.3：1.03，所以应提倡使用氮、磷、钾之比为两头高中间低的水溶肥品种（如紫金花22-8-25+TE），特别注重钾以及中、微量元素投入。大力推广有机肥和无机复合肥的合理施用，使养分协调，抑制土壤的酸化倾向。
5.施用酸性土壤调理剂 有研究表明，碱渣、菇渣、污泥、泥炭等土壤调理剂均能提高土壤pH，降低酸性土壤交换性铝含量提高土壤有机质、速效氮、速效磷、速效钾、交换性钙、交换性镁含量。施用格鲁克净土，可改良酸性土壤，激活土壤中大量的中微量元素，使瘦土变肥土，同时释放大量的氧气，增强土壤通透性，减少土壤板结。